Innhold

• Programvareoversikt
• Støttede filtyper
• Primær filutvidelse
• Andre filutvidelser som brukes av Integrated Genome Browser 9

Versjon (per 6/29/2016)	9
plattformer
Tillatelse	Åpen kilde
Kategori	Vitenskapelig

Mer info (besøk utgiverens nettsted)

Vurdering: 2.8 / 5 (6 Stemmer)

Programvareoversikt

Hovedtrekkene

• Støtter ulike genomformater som GenBank og FASTA
• Interagere med data med zooming og panorering animasjoner
• Få tilgang til og last gjennomgener fra QuickLoads nettsteder
• Transform data til ulike grafformer
• Del data med samarbeidspartnere gjennom Dropbox
• Installer plugins for ekstra funksjonalitet

Integrert Genome Browser (IGB) er et åpen kildekodeprogram som brukes til å vise og utforske store genomiske datasett. Du kan vise ulike dataformater, samhandle med dataene dine, lage grafer, lagre informasjonen din som bilder, og dele data med samarbeidspartnere.

IGB lar deg vise data fra merknader og justerte sekvenser. Programmet støtter en rekke formater som FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband og GenBank. Du kan ta data og omforme det til en rekke grafformer, inkludert feilparametre for å markere dataforskjeller og dybdediagrammer for å vise dekning. Du kan også samhandle med dataene dine gjennom IGBs zoomings- og panoreringanimasjoner.

IGB lar deg få tilgang til og laste genene fra QuickLoad-nettsteder, som er enkle systemer av kataloger, sekvenser og andre datafiler for visualiseringsformål. IGB gir avansert funksjonalitet med plugin-støtte for å legge til funksjonalitet og arbeidsflytautomatisering ved hjelp av skript. IGB gir deg også avanserte funksjoner for å dele dataene dine, uansett om de publiseres som et høyverdig JPEG, PNG eller SVG-bilde eller lagrer data i Dropbox for å gi samarbeidspartnere tilgang til prosjektet ditt.

IGB brukes primært av universitetsforskere, biologer og bioinformatikere. Det gir avanserte verktøy for å åpne en rekke genoom dataformater, visualisere data som forskjellige grafer, og dele data med samarbeidspartnere. Dessverre er programmet avhengig av tilskudd for fortsatt utvikling, noe som betyr at støtte til søknaden kan opphøre når som helst. Imidlertid er Integrated Genome Browser fortsatt et egnet, tilpassbart program for brukere som ønsker å utforske og analysere sine genomdata.

Støttede filtyper

Primær filutvidelse

XML - XML-fil

Andre filutvidelser som brukes av Integrated Genome Browser 9

Støttede filtyper
.SENG	UCSC BED Annotation Track File
.DAS	DeltaMaster analyse sesjon
.FA	FASTA formatert sekvensfil
.FAS	FASTA sekvensfil
.FASTA	FASTA sekvensfil
.GB	GenBank Data File
.SGR	SGR Genome Data File
.USEQ	USeq Genome Data File